彩都鉄道と越信鉄道は連絡運輸協定を締結し、直通運転を行っています。
直通運転は、「ブルーライナー」・「グリーンライナー」および朝夕時間帯の「あさなぎライナー」・「ゆうなぎライナー」の4種類の列車で行います。
ブルーライナーは、
長野―(彩都鉄道北信線)―上田―(越信鉄道上田線)―信濃市
の路線を経由します。停車駅は、
長野・屋代・西上田・上田・信濃中央・信濃本都心・信濃市
です。
グリーンライナーは、
彩都中央―(彩都鉄道屋代線)―屋代―(彩都鉄道北信線)―上田―(越信鉄道上田線)―信濃中央
の路線を経由します。停車駅は、
彩都中央・彩都市・彩都セントラルパーク・屋代・西上田・上田・信濃中央・信濃本都心・信濃市
です。
あさなぎライナー・ゆうなぎライナーの運転区間・停車駅は、ブルーライナーと同じですが、朝夕の通勤・通学に利用しやすい時間帯に運転します。
あさなぎライナーは、朝ラッシュ時に、信濃市始発長野行きを運転します。
ゆうなぎライナーは、夕ラッシュ時に、長野始発信濃市行きを運転します。
※ダイヤの乱れ等により、急遽直通運転を中止する場合がございます。